مجلس الإدارة مسؤول أساسا عن اعتماد السياسات، واستراتيجية العمليات، والموازنة، والسير العام لعمليات المؤسسة ضمن الصلاحيات المفوّضة إليه من الجمعية العمومية. ويتألف مجلس الإدارة من 10 أعضاء (منهم الرئيس)، ويرأسه رئيس مجموعة البنك. أما الأعضاء الآخرون فهم ممثلو البنك، ومجموعات الدول الأعضاء من إفريقيا، وآسيا، ودول آسيا العربية، والمؤسسات المالية العامة، وعضو دائم من المملكة العربية السعودية (يمثل أكبر مساهم بعد البنك).
ووفقًا لاتفاقية التأسيس، يجتمع مجلس الإدارة عندما تقتضي أعمال المؤسسة ذلك، وتمثل أغلبية أعضاء المجلس النصابَ القانوني لأيّ اجتماع، بشرط أن تمثل هذه الأغلبية على الأقل ثلثي مجموع القوة التصويتية للأعضاء. ويجوز أيضًا الدعوة إلى عقد اجتماع خاص في أيّ وقت من قبل رئيس مجلس الإدارة أو بناءً على طلب ثلاثة من أعضائه.
ويكون لأعضاء مجلس الإدارة الذين يعيّنهم البنك أصوات البنك مقسّمة بالتساوي بينهم، ويحقّ لكلّ عضو من أعضاء مجلس الإدارة الإدلاء بعدد من الأصوات يعادل عدد الأصوات المحتسبة لانتخابه والمخوَّلة لأعضاء المؤسسة المنتخِبين.
ويخوَّل مجلس إدارة المؤسسة وفقًا لنظامها الداخلي ممارسةَ جميع صلاحيات المؤسسة، ما عدا الصلاحيات المخصصة للجمعية العمومية، وكذلك وضعَ الشروط والإجراءات التي يجوز لرئيس مجلس الإدارة بموجبها تقديم شتّى أنواع المسائل في إطار إجراء عاجل.